许多引起人类遗传病的突变都是由单个核苷酸的取代而造成的。寡聚核苷酸的连接作用可提供一个快速检测单个核苷酸差异的手段。这种分析方法要使用成对的寡聚核苷酸：其中一个被生物素标记，另一个具有放射性标记或荧光标记。图Q25.5(b)的一对寡聚核苷酸是为了检测镰状细胞白血病[图Q25.5(a)]而设计的。
在分析过程中，分别将不同个体的DNA在有DNA连接酶的存在下，两两配对进行寡聚核苷酸杂交。将生物素酰化的寡聚核苷酸结合到固相支持物的抗生物素链霉蛋白上，然后通过放射自显影检查杂交结果，如图Q25.5(c)所示。

图Q25.5寡聚核苷酸连接分析(a)β-珠蛋白基因的β镰状细胞(βS)突变区的序列；(b)用于连接分忻的特异性的寡聚核苷酸；(c)βAβS之间单个碱基差异的检测分析，将生物素酰化的寡聚核苷酸收集在一个点，然后测定放射性