肺炎衣原体的原体经卢戈碘染色后与沙眼衣原体的原体形态不同，呈典型的梨形，并有清晰的胞浆间隙，在胞浆中还有数个电子致密的圆形小体存在。而沙眼衣原体的原体因合成的糖原掺入到包涵体的基质中，因而胞浆间隙不清晰。

衣原体诊断包括直接涂片镜检查包涵体、免疫荧光、组织培养分离衣原体、PCR检测特异性核酸等。冷凝集试验通常用来检测肺炎支原体感染。

衣原体的特征是革兰阴性，圆形或椭圆形体。有细胞壁，和细菌不同处是无肽聚糖，只含微量胞壁酸，有二硫键连接的多肽作为支架。具有独特的发育周期，类似细菌以二分裂方式繁殖。含有DNA和RNA两种核酸。有核蛋白体，能进行多种代谢，但不能合成带高能键的化合物，必须利用宿主细胞的磷酸腺苷和中间代谢产物作为能量来源。对某些抗生素敏感。

网状体或称始体为宿主细胞内的繁殖型，代谢活跃，不能在胞外存活，无感染性。

衣原体是一类专性细胞内寄生的微生物，有独特发育周期，原体是衣原体胞外的存在形式，具有高度的感染性，网状体或称始体无胞壁无致密核，无感染性。

衣原体具有坚韧细胞壁，也具有肽聚糖层。

原体具有感染性，网状体具有繁殖能力。

由衣原体沙眼生物变种A、B、Ba、C血清型引起。主要经直接或间接接触传播，即眼~眼或眼-手-眼的途经传播。

dD-K血清型引起性传播的非淋菌性泌尿生殖道感染。