针对检查应付账款是否计入了正确的会计期间，是否存在未入账的应付账款，审计程序包括：
（1）对本期发生的应付账款增减变动，检查至相关支持性文件，确认会计处理是否正确；
（2）检查资产负债表日后应付账款明细账贷方发生额的相应凭证，关注其购货发票的日期，确认其入账时间是否合理（选项A正确）；
（3）获取并检查被审计单位与其供应商之间的对账单以及被审计单位编制的差异调节表，确定应付账款金额的准确性（选项B正确）；
（4）针对资产负债表日后付款项目，检查银行对账单及有关付款凭证（如银行汇款通知、供应商收据等），询问被审计单位内部或外部的知情人员，查找有无未及时入账的应付账款（选项C正确）；
（5）结合存货监盘程序，检查被审计单位在资产负债日前后的存货入库资料（验收报告或入库单），检查相关负债是否计入了正确的会计期间（选项D正确）。

选项C属于“检查应付账款是否计入了正确的会计期间”的审计程序，不符合题意。

针对除折旧／摊销、人工费用以外的一般费用，实施实质性分析程序：
（1）考虑可获取信息的来源、可比性、性质和相关性以及与信息编制相关的控制，评价在对记录的金额或比率作出预期时使用数据的可靠性。
（2）将费用细化到适当层次，根据关键因素和相互关系（例如本期预算、费用类别与销售数量、职工人数的变化之间的关系等）设定预期值，评价预期值是否足够精确以识别重大错报。
（3）确定已记录金额与预期值之间可接受的、无需作进一步调查的可接受的差异额。
（4）将已记录金额与期望值进行比较，识别需要进一步调查的差异。
（5）调查差异，询问管理层，针对管理层的答复获取适当的审计证据；根据具体情况在必要时实施其他审计程序。

选项A、C所设计的审计程序还没有追查到应付账款明细账，不能获取有效的审计证据证实采购交易记录的完整性认定。

根据控制活动的职责分离原则，负责授权、记录与资产保管的职责应当分给不同的员工，记录现金支出的人员不得负责资产保管，包括不得负责现金、有价证券和其他资产的经手及保管（选项C错误）。

由于函证应付账款不能保证查出未入账的应付账款，一般情况下，应付账款不一定需要函证。

选项C错误。注册会计师以应付账款明细账为起点追查至相关原始凭证（即“逆查”的方向），能够获取审计证据证明应付账款的存在认定。

已到期的应付款项须经有关授权人员审批后方可办理结算与支付，但不能由一个人既负责审批，又负责支付款项（选项B错误）。